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細(xì)胞工廠是在大規(guī)模細(xì)胞培養(yǎng)中應(yīng)用較多的一類耗材，細(xì)胞是一種非常脆弱的生物，細(xì)胞的體外培養(yǎng)需要特定的環(huán)境，其中無菌是基本的要求。

細(xì)胞在活體內(nèi)，解毒系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)可抵抗微生物或其他有害物質(zhì)的入侵，但細(xì)胞在體外培養(yǎng)的過程中，缺乏機(jī)體免疫系統(tǒng)的保護(hù)而喪失對(duì)微生物的防御能力和對(duì)有害物質(zhì)的解毒能力。為保證細(xì)胞能在體外環(huán)境中生長(zhǎng)繁殖，必須要確保無菌工作區(qū)域、良好的個(gè)人衛(wèi)生、無菌試劑和培養(yǎng)基以及無菌操作。

細(xì)胞工廠培養(yǎng)細(xì)胞時(shí)常見的微生物污染有支原體、細(xì)菌、真菌。支原體無致死毒性，可與細(xì)胞長(zhǎng)期共存，對(duì)細(xì)胞有潛在影響，但體積小，不易鑒別，可借助于地衣紅或Hoechst33342染色來進(jìn)行檢測(cè)。細(xì)菌增殖快，在短時(shí)間內(nèi)即可大量擴(kuò)增，并產(chǎn)生毒素殺死細(xì)胞。真菌的種類繁多，肉眼可見，漂浮于培養(yǎng)液面上，可呈絲狀、管狀或樹枝狀等。

如果細(xì)胞工廠內(nèi)的細(xì)胞發(fā)生細(xì)菌污染，要根據(jù)具體情況分析污染源，然后依據(jù)污染情況進(jìn)行處理，如果污染已經(jīng)非常嚴(yán)重，建議丟棄培養(yǎng)物，重新培養(yǎng)。